复旦大学出版社成立于1981年，由复旦大学主办，受教育部和上海市新闻出版局双重管辖。2001年经教育部和新闻出版总署批准，复旦大学出版社与上海医科大学出版社两社合并，成立新的复旦大学出版社，下辖二级社复旦大学电子音像出版社。